Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BROXQ5VW32 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms