Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GARNL3Q5VVW2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms