Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KHDC3LQ587J8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KHDC3LQ587J8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms