Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC93Q567U6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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