Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC96Q2M329 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms