Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM187BQ17R55 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM187BQ17R55 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms