Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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