Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACKR1Q16570 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACKR1Q16570 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACKR1Q16570 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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