Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDCD2Q16342 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms