Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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