Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC85BQ15834 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC85BQ15834 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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