Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA2Q15822 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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