Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITSN1Q15811 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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