Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TAF1AQ15573 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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