Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SS18Q15532 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18Q15532 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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SS18Q15532 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SS18Q15532 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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