Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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