Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSHL1Q14406 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSHL1Q14406 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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