Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNC3Q14003 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms