Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF5Q13568 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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