Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAE1Q13564 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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