Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMK2BQ13554 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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