Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3AQ13472 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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