Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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ITGB3BPQ13352 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGB3BPQ13352 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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