Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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