Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CHAF1AQ13111 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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