Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAF2Q12933 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF2Q12933 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms