Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHD3Q12873 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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