Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFFO1Q0D2I5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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