Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf54Q08AI8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf54Q08AI8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms