Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4DQ08499 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms