Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EMX1Q04741 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms