Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms