Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POU5F1Q01860 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms