Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SCN7AQ01118 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCN7AQ01118 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms