Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms