Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK5Q00535 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK5Q00535 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK5Q00535 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDK5Q00535 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms