Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms