Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSNK2BP67870 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms