Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO4P61968 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO4P61968 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO4P61968 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO4P61968 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO4P61968 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO4P61968 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO4P61968 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LMO4P61968 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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