Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPCS3P61009 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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