Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BACE1P56817 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BACE1P56817 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BACE1P56817 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BACE1P56817 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BACE1P56817 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BACE1P56817 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BACE1P56817 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms