Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms