Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AP3M2P53677 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms