Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms