Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ME1P48163 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms