Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UTRNP46939 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UTRNP46939 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UTRNP46939 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UTRNP46939 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UTRNP46939 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms