Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms