Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms