Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTX2P32243 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTX2P32243 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms