Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms